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GENYCA INNOVA ha sido el primer centro de la Comunidad de Madrid en obtener la autorización como Unidad de Genética por parte de la Dirección General de Calidad, Acreditación, Evaluación e Inspección de la Consejería de Sanidad y Consumo de la Comunidad de Madrid (Licencia Sanitaria nº CS6992).
GENYCA INNOVA realiza los análisis siguiendo procedimientos y protocolos adaptados según recomendaciones de la European Molecular Genetics Quality Network (EMQN), cumpliendo los requisitos técnicos y metodológicos necesarios para conseguir la certificación del sistema de gestión de calidad, de acuerdo con la norma ISO 17025:2005. Además participa activamente en controles de calidad externos para enfermedades hereditarias y agentes infecciosos.